明憲宗年間，宦官弄權(quán)，濫殺賢臣。俠客周淮安（李連杰飾）在營(yíng)救忠良行動(dòng)中，終將惡貫滿盈的東廠提督曹少欽一劍斃命，引來(lái)西廠督主雨化田（陳坤飾）祭出天下格殺令。周淮安等人一路亡命到嘉峪關(guān)的龍門，消失於鋪天蓋地的黑沙暴中。塵銷風(fēng)散后，西廠密探、韃靼商隊(duì)等江湖各路人馬，再度投宿於龍門客棧這家大漠黑店。
三年前曾毀於大火的龍門客棧里，當(dāng)年的風(fēng)騷老板娘金鑲玉早已神秘失蹤，只剩逃過(guò)火劫的夥計(jì)們重起爐灶，癡等老板娘回來(lái)。幾乎被世人遺忘的邊關(guān)客棧，再次因緣際會(huì)地風(fēng)起云涌：神秘劍客胡中玉的容貌，為何與雨化田如此相似？對(duì)客棧密道了若指掌的吹笛女子凌雁秋（周迅飾），難道就是金鑲玉本人？就在由雨化田親率的西廠追兵趕來(lái)之際，地平線突刮起數(shù)條龍卷奇風(fēng)，周淮安橫空飛出，欲與雨化田一決生死。大漠風(fēng)煙間，一場(chǎng)天地變色的正邪之戰(zhàn)，即將展開(kāi)。